巨人に対する真の勝利を獲得すべく、調査兵団はウォール･マリア奪還最終作戦を決行する。作戦の内容はウォール･マリアのシガンシナ区に空いた穴を、エレンの硬質化能力によって塞ぐというもの。そして、ウォール･マリア内にあるエレンの生家の地下室に眠る｢真実｣を目指す。だが、そこには｢獣の巨人｣たちが待ち構えていた! 巨人と調査兵団。最終決戦が、いま始まる。